Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMC8O43402 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMC8O43402 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMC8O43402 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMC8O43402 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMC8O43402 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMC8O43402 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMC8O43402 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMC8O43402 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMC8O43402 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMC8O43402 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMC8O43402 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMC8O43402 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMC8O43402 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMC8O43402 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMC8O43402 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMC8O43402 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EMC8O43402 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EMC8O43402 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EMC8O43402 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMC8O43402 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMC8O43402 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms