Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APAF1O14727 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APAF1O14727 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APAF1O14727 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APAF1O14727 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APAF1O14727 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APAF1O14727 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APAF1O14727 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APAF1O14727 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APAF1O14727 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms