Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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