Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
USP17L12C9JPN9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms