Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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