Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms