Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf170A2RU37 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf170A2RU37 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms