Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms