Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms