Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms