Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms