Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDZRN3Q9UPQ7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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PDZRN3Q9UPQ7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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PDZRN3Q9UPQ7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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PDZRN3Q9UPQ7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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PDZRN3Q9UPQ7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZRN3Q9UPQ7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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