Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms