Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms