Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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COPS3Q9UNS2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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COPS3Q9UNS2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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COPS3Q9UNS2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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COPS3Q9UNS2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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