Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms