Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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