Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAX2Q9UIW0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms