Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms