Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms