Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms