Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ABRACLQ9P1F3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABRACLQ9P1F3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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