Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms