Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms