Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms