Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms