Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TDRD1Q9BXT4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms