Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms