Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms