Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms