Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms