Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms