Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms