Protein–RNA interactions for Protein: Q96RU3

FNBP1, Formin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNBP1Q96RU3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FNBP1Q96RU3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNBP1Q96RU3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms