Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms