Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF34Q969K3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms