Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY2Q8WXA3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY2Q8WXA3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms