Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms