Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms