Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC112Q8NEF3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms