Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CLIP4Q8N3C7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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