Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms