Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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