Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms