Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms