Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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