Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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ATP6V1FQ16864 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ATP6V1FQ16864 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ATP6V1FQ16864 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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