Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
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RTN1Q16799 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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RTN1Q16799 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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RTN1Q16799 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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RTN1Q16799 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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RTN1Q16799 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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RTN1Q16799 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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RTN1Q16799 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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RTN1Q16799 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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