Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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