Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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